En fait, ce n'est pas un problème, seulement une configuration parfois nécessaire à faire.
Je vais expliquer un peu ce qui se passe réelement.
Lorsque Windows démarre, il considère l'heure que vous avez configuré dans votre bios comme heure locale du système, là il n'y a rien à dire.
Ce qui n'est pas le cas de Debian. Debian, lui, considère cette heure comme UTC pour ensuite afficher l'heure local, là est la cause de cette difference d'heure entre les deux systèmes.
Voici ce qu'il faut faire:
Avant tout, il faut installet NTP, rien de plus facile ;)
apt-get install ntpPuis, le principe est de dire à Debian qu'il faut considérer cette heure configuré dans le bios comme heure locale.
Ouvrir le fichier suivant avec votre navigateur favori:
vim /etc/adjtimeEt changer UTC en LOCAL
Voilà :)